| Téléchargement | - Voir le manuscrit accepté : A Novel Data Mining Technique for Gene Identification in Time-Series Gene Expression Data (PDF, 739 Kio)
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| Auteur | Rechercher : Famili, Fazel; Rechercher : Liu, Ziying; Rechercher : Ouyang, Junjun; Rechercher : Walker, P.R.; Rechercher : Smith, B.; Rechercher : O'Connor, M.; Rechercher : Lenferink, A. |
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| Format | Texte, Article |
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| Conférence | The 16th European Conference on Artificial Intelligence (ECAI 2004), August 22-27, 2004, Valencia, Spain |
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| Sujet | extraction de données; génomique; identification de gènes; expression de gènes; séries chronologiques; biopuces |
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| Résumé | La présente étude visait à élaborer une méthode permettant d'identifier les profils utiles dans les séries chronologiques de données d'expression de gènes. Nous avons mis au point une nouvelle approche d'extraction de données qui permet d'identifier les profils dignes d'intérêt. La méthode consiste en une combinaison de pré-traitement de données ainsi que de techniques d'apprentissage supervisé et non supervisé. Pour évaluer notre approche, nous avons analysé trois séries chronologiques d'ensembles de données ayant trait aux variations temporelles du transcriptome qui se produisent durant : 1) le cycle cellulaire de la levure lors du bourgeonnement (<em>S. cerevisiae</em>) [3]; 2) la transition de cellules épithéliales à mésenchymateuses que subissent les cellules mammaires BRI JM01 de souris sous l'effet du facteur de croissance transformant ?1; et 3) la différenciation induite par l'acide rétinoïque chez les cellules NT 2 de tératocarcinome humain. Nous présentons les résultats de toutes nos expériences, discutons des profils découverts au moyen de notre approche et expliquons brièvement nos plans futurs et l'orientation que nous prévoyons prendre pour perfectionner notre méthode. |
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| Date de publication | 2004 |
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| Dans | |
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| Langue | anglais |
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| Numéro du CNRC | NRCC 47142 |
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| Numéro NPARC | 5764970 |
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| Identificateur de l’enregistrement | 14d41bd3-87fb-46f6-b86b-291ff0eb7c13 |
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| Enregistrement créé | 2009-03-29 |
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| Enregistrement modifié | 2021-01-05 |
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