| Téléchargement | - Voir le manuscrit accepté : Goal Driven Analysis of cDNA Microarray Data (PDF, 1.1 Mio)
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| Auteur | Rechercher : Pan, Youlian1; Rechercher : Zou, Jitao2; Rechercher : Huang, Yi2; Rechercher : Liu, Ziying1; Rechercher : Phan, Sieu1; Rechercher : Famili, Fazel A.1 |
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| Affiliation | - Conseil national de recherches du Canada. Institut de technologie de l'information du CNRC
- Conseil national de recherches du Canada. Institut de biotechnologie des plantes du CNRC
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| Format | Texte, Article |
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| Conférence | IEEE Symposium on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology, Nashville, TN., USA, March 30 - April 02, 2009 |
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| ISBN | 978-1-4244-2756-7 |
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| Sujet | Microarray data analysis; gene expression; differentially expressed genes; transcriptional regulation |
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| Résumé | La technologie des puces à ADN (ou biopuces) a largement été appliquée à des études sur l'expression des gènes à grande échelle. Le principal objectif durant le processus de fouille des données est de s’équiper d’un arsenal d’outils adéquats pour pouvoir transformer les données en informations pertinentes. Nous nous sommes attelés à ce problème en utilisant une biopuce d'endosperme de Brassica en combinaison avec des données d’étiquette de séquence transcrite (EST) afin de valider notre méthode. Nous nous sommes intéressés en particulier aux gènes fortement exprimés dans l'endosperme de Brassica et à leur variation d’expression et à leurs fonctions au cours des différents stades du développement embryonnaire. Nous avons également procédé à la caractérisation de ces gènes par analyse ontologique. Nos résultats montrent que la conception d'une séquence opérationnelle précise d’extraction des données intégrant à la fois le logarithme du rapport et de l'intensité du signal facilite l’acquisition des connaissances. Grâce à cette approche, nous avons pu mettre à jour un mécanisme de régulation entre les deux facteurs de transcription les plus importants de l’endosperme de Brassica napus, LEC1 et WRI1. |
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| Date de publication | 2009 |
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| Dans | |
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| Langue | anglais |
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| Publications évaluées par des pairs | Oui |
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| Numéro du CNRC | NRCC 50745 |
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| Numéro NPARC | 16488512 |
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| Exporter la notice | Exporter en format RIS |
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| Identificateur de l’enregistrement | 22b4993d-6f62-474f-8fe9-1c465ef73b58 |
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| Enregistrement créé | 2010-12-03 |
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| Enregistrement modifié | 2020-04-16 |
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