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| DOI | Trouver le DOI : https://doi.org/10.1139/W10-028 |
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| Auteur | Rechercher : Yeung, C. William1; Rechercher : Lee, Kenneth; Rechercher : Whyte, Lyle G.; Rechercher : Greer, Charles W.1 |
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| Affiliation | - Conseil national de recherches du Canada. Institut de recherche en biotechnologie du CNRC
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| Format | Texte, Article |
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| Sujet | Microbial community structure; Phylogenetic diversity; DGGE; Structure de la communauté microbienne; Diversité phylogénique; DGGE; ARNr 16S |
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| Résumé | Le Goulet est la première aire marine protégée de Pêches et Océans Canada située au large de la côte Est canadienne. Afin d’assurer le succès des efforts de conservation dans cette aire, il est essentiel de mieux comprendre la composition de la communauté microbienne qui s’échelonne de la zone euphotique vers les eaux profondes dans cet environnement encore non étudié. L’électrophorèse en gradient de gel dénaturant (DGGE) et le séquençage de nucléotides ont été utilisés pour caractériser la structure de la communauté microbienne. Les résultats de la DGGE ont montré une différence marquée entre la structure de la communauté de la zone euphotique et celle trouvée en eau profonde. Une analyse de grappe a montré un haut degré de similarité (>85 %) entre tous les échantillons prélevés à des profondeurs sous les 500 m, mais un degré moins élevé (49 % – 72 %) lorsque les échantillons prélevés au dessus et en dessous de 500 m étaient comparés. Les changements dans la structure de la communauté microbienne en fonction de la profondeur correspondaient bien avec les paramètres physiques océanographiques. De plus, l’analyse du gène de l’ARNr 16S a montré que les séquences des bactérioplanctons se groupaient généralement dans 1 des 9 lignages principaux communément trouvés dans les systèmes marins. Cependant, les lignages n’étaient pas tous détectés à toutes les profondeurs. Les séquences de SAR11 et de SAR116 n’étaient présentes que dans les eaux de surfaces alors que les séquences de SAR324 et d’Actinobacteria n’étaient présentes qu’en eaux profondes. Ces résultats fournissent une caractérisation préliminaire des communautés microbiennes de cet écosystème unique. |
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| Date de publication | 2010 |
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| Dans | |
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| Langue | anglais |
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| Publications évaluées par des pairs | Oui |
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| Numéro du CNRC | NRCC 53322 |
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| Numéro NPARC | 15825995 |
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| Exporter la notice | Exporter en format RIS |
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| Identificateur de l’enregistrement | 2dd9bfa4-b6fc-493f-b096-9797b389ebb0 |
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| Enregistrement créé | 2010-11-05 |
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| Enregistrement modifié | 2020-04-17 |
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