| Téléchargement | - Voir le manuscrit accepté : Molecular characterization of microbial communities in Canadian pulp and paper activated sludge and quantification of a novel Thiothrix eikelboomii -like bulking filament (PDF, 1.2 Mio)
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| DOI | Trouver le DOI : https://doi.org/10.1139/w05-160 |
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| Auteur | Rechercher : Dumonceaux, Tim J; Rechercher : Hill, Janet E1; Rechercher : Pelletier, Carl P; Rechercher : Paice, Michael G; Rechercher : Van Kessel, Andrew G; Rechercher : Hemmingsen, Sean M1 |
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| Affiliation | - Conseil national de recherches du Canada. Institut de biotechnologie des plantes du CNRC
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| Format | Texte, Article |
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| Sujet | boues activées; traitement biologique; gonflement; chaperonine 60; cpn60; bactéries filamenteuses; liqueurs de solides suspendus mélangés; communautés microbiennes; 021N; qPCR; décantation; Thiothrix |
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| Résumé | Nous avons examiné la structure de la communauté microbienne et quantifié les niveaux de l'organisme filamenteux de gonflement Thiothrix eikelboomii dans les échantillons de liqueurs de solides suspendus mélangés (LSSM) de boues activées provenant d'usines de pâtes et papiers canadiennes. Des banques de séquences géniques de la chaperonine-60 (cpn60) ont été préparées à partir d'ADN de communautés microbiennes totales de LSSM et chacune fut comparée à la cpnDB, une base de données de référence des séquences de cpn60 (http://cpndb.cbr.nrc.ca) pour l'allocation des identités taxonomiques. Des séquences semblables mais distinctes de la souche type de T. eikelboomii AP3 (ATCC 49799ᵀ) (~89 % d'identité parmi les 555 pb) ont été recueillies à une fréquence élevée d'un échantillon d'usine qui éprouvait des problèmes de gonflement au moment de l'échantillonnage, ce qui correspondait à des observations microscopiques utilisant l'hybridation fluorescente in situ avec des sondes d'ADNr 16S commerciales. Nous avons fait le décompte de cette souche dans cinq échantillons de LSSM provenant d'usines à l'aide du PCR quantitatif en temps réel (qPCR) et avons constaté que deux échantillons avaient des niveaux élevés de la souche de gonflement (>10¹² génomes/g LSSM) et deux contenaient des niveaux intérieurs mais détectables de cet organisme. Aucun des échantillons d'usine ne contenait des séquences de cpn60 identiques à la souche type de T. eikelboomii. Cette technique est prometteuse pour la surveillance des systèmes de traitement des eaux usées des usines de pâtes et papiers en détectant et énumérant cette souche de T. eikelboomii, qui pourraient être spécifique au système de traitement des eaux usées des usines de pâtes et papiers. |
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| Date de publication | 2006-05-01 |
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| Maison d’édition | Canadian Science Publishing |
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| Dans | |
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| Langue | anglais |
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| Publications évaluées par des pairs | Oui |
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| Identificateur de l’enregistrement | be1152d3-f534-462e-bc75-bfee8df80266 |
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| Enregistrement créé | 2023-10-18 |
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| Enregistrement modifié | 2024-05-22 |
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